Marian Siwek jest autorem portretów Jerzego Panka,
Idy Haendel,
Tadeusza Kantora, czy Jonasza Sterna. Wykonał jedyny na świecie rysowany dokument Straceńcy (1981/1982) ilustrujący masakrę górników w kopalni „Wujek” (1981). Ważniejsze cykle rysunków to: Krwawa wiosna w Grudniu (1971), Szkice telewizyjne (1980/1981), Teatr paniki (lata 80.), Idąc ulicami Krakowa (lata 90. do 2005), Śmierć Karoliny (1998–2000), Dziwolągi (2005/2006), Konie (1965–2005), Sceny rodzinne (1970–2003), Maria Magdalena (1998). Jego rysunki poruszają tematykę społeczną i polityczną.